染色體檢查費用一般在400~3000之間，如果是夫妻二人的話價格就需要乘以二，費用跨度較大的主要原因就是染色體對於醫療裝置較為嚴格，而且目前發現了超過300種染色體異常所誘發或者遺傳的疾病，檢查專案非常多。染色體檢查費用不在醫保報銷範圍內，需要全部自費，一般醫院等級越高，收費也會越貴，不過相對的精度和檢查覆蓋範圍也會更廣，具體費用是需要到醫院諮詢瞭解的，價格因人而異。
目前新生兒染色體異常發病率在1/800左右，最常見的染色體疾病包括唐氏綜合徵、血友病、先天性心臟病等。對於特定人群來說，可以選擇在懷孕12周之前做無創DNA，主要是針對胎兒的檢查，一般價格在1500元左右，無創DNA（PLSU）價格在2500~3000元，當然想要更加保險的話，也可以在孕前做一個全方面的染色體檢查，因檢查專案不同收費也有所不同，具體如下：
- 1. 染色體核型分析：400元左右，包括外周血、臍帶血、羊水、絨毛、骨髓血細胞、胸腹的染色體核型分析，只能檢查大於5Mbp的改變，其精度不算太高，一般針對21三體、18三體、13三體、Turner綜合徵等常見染色體疾病；
- 2. 組織染色體晶片檢查：2400元左右，一種比較全面的染色體檢查方式，可以輕易檢測出10k-5Mbp的小片段缺失重複，比如獨立的marker，依附於特定染色體的add，啞鈴形的雙微體，環狀染色體等，缺點是不能檢測出染色體遺傳物質總體平衡的異常；
- 3. 高通量基因測序篩查：4000元以上，能檢測到最小尺度上的遺傳變異，解析度>百萬級，可應用在無創DNA、羊水穿刺等染色體檢測上；
- 4. 全外顯子組基因檢測：8000元左右，能夠檢測出人類大部分基因疾病，是基於高通量測序原理的一項診斷性質的檢測，對於一般人來說沒有必要進行這種檢測。
